磁珠法核酸提取

發布時間:

2024-05-17 15:14

磁珠法核酸提取

随着疫情相關信息的傳播,許多(duō)先前不為(wèi)大衆所知的診斷行業專業名(míng)詞逐漸變得家喻戶曉,如核酸檢測、試劑盒、咽拭子、假陰性等等。我們在進行核酸檢測的時候,通常需要在檢測之前經曆核酸提取這一步驟,簡單來說将病毒的核酸從我們采集的樣本當中(zhōng)提取出來,以用(yòng)于後續實驗。通過對磁珠進行一定的包被(如矽基、氨基、羧基等),從而可(kě)以實現對核酸的高通量、自動化提取,這一技(jì )術産(chǎn)生于20世紀80年代,已經有(yǒu)了成熟的試劑盒并形成為(wèi)産(chǎn)業。

磁珠法核酸提取法基本原理(lǐ):

首先,磁珠是一類特殊的納微米材料,它們的尺寸通常在零點幾微米到幾微米之間,僅為(wèi)一根頭發絲直徑的十幾分(fēn)之一到幾十分(fēn)之一,肉眼是無法觀測到單個磁珠的。

其次,它們具(jù)有(yǒu)超順磁性,在磁場中(zhōng)可(kě)以向一側迅速移動,聚集在一起,而去除磁場後又(yòu)能(néng)夠迅速恢複到分(fēn)散狀态。

再次,用(yòng)于核酸提取的磁珠表面具(jù)有(yǒu)特定的性質(zhì),在某些條件下能(néng)夠将病毒核酸吸附在表面,在另一些條件下又(yòu)能(néng)将病毒核酸從表面釋放下來,用(yòng)于後續的檢測步驟。核酸結合到磁珠上主要依靠靜電(diàn)作(zuò)用(yòng)、疏水作(zuò)用(yòng)和氫鍵作(zuò)用(yòng)。細胞或組織在裂解液作(zuò)用(yòng)下,其中(zhōng)的DNA/RNA被釋放出來。此時經過表面修飾的超順磁性氧化矽納米磁珠即與核酸進行“特異性結合”,形成“核酸-磁珠複合物(wù)”。然後在外加磁場的作(zuò)用(yòng)下,複合物(wù)即分(fēn)離出來。而後經過洗脫液洗去非特異性吸附的雜質(zhì)、去鹽、純化後,即得到欲提取的核酸物(wù)質(zhì)。

磁珠如何與核酸結合實現提取功能(néng)? 

核酸作(zuò)為(wèi)一種生物(wù)大分(fēn)子,之所以能(néng)夠在水溶液中(zhōng)穩定分(fēn)散不沉澱,是由于三種非共價作(zuò)用(yòng)力的存在:(1)靜電(diàn)相互作(zuò)用(yòng)(2)範德(dé)華力(3)氫鍵。核酸分(fēn)子具(jù)有(yǒu)多(duō)個磷酸基團,呈現高度負電(diàn)性,分(fēn)子間互相排斥從而避免發生團聚。此外,核酸分(fēn)子在水溶液中(zhōng)通過氫鍵與範德(dé)華力結合了大量的水分(fēn)子在其周圍,形成一個水化層,也阻止了分(fēn)子間的聚集。因此,要使得核酸分(fēn)子結合到磁珠表面,必須削弱上述作(zuò)用(yòng)力,屏蔽溶液中(zhōng)的靜電(diàn)斥力,同時破壞核酸分(fēn)子表面的水化層,使其能(néng)夠與磁珠表面相接觸,進而産(chǎn)生吸附。

磁珠法核酸提取步驟:

一般可(kě)以分(fēn)為(wèi)四步:裂解——結合——洗滌——洗脫。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

圖一:磁珠法核酸提取過程示意圖

磁珠法核酸提取試劑盒的優勢

①能(néng)夠實現自動化、大批量操作(zuò),目前有(yǒu)96通道的核酸自動提取儀,用(yòng)一個樣品的提取時間即可(kě)實現對96個樣品的處理(lǐ),符合生物(wù)學(xué)高通量的操作(zuò)要求,使得傳染性疾病爆發時能(néng)夠進行快速及時的應對(例如新(xīn)冠肺炎),這一特點使得傳統方法望塵莫及;

②操作(zuò)簡單、用(yòng)時短,整個提取流程隻有(yǒu)四步,大多(duō)可(kě)以在30分(fēn)鍾内完成;

③不使用(yòng)傳統方法中(zhōng)的苯酚、氯仿等有(yǒu)毒試劑,對實驗操作(zuò)人員的傷害減少,完全符合現代環保理(lǐ)念;

④磁珠與核酸的特異性結合使得提取的核酸純度高、濃度大。

如何評估磁珠法提取核酸的效果?

這裏給出三個評價尺度:

Purity(純度),具(jù)體(tǐ)而言是磁珠提取後的核酸中(zhōng)含有(yǒu)多(duō)少非核酸類的雜質(zhì)殘留,如蛋白、鹽、多(duō)糖等。該指标通常用(yòng)吸光度比值(A260/A280和A260/A230)來衡量。

Q指的是Quality(質(zhì)量),磁珠提取後的核酸尤其是較長(cháng)的基因組核酸應保持其完整性,不應出現斷裂或降解等現象。該指标可(kě)通過簡單的凝膠電(diàn)泳或者複雜一些的特定PCR及微流控芯片進行評估。

R指的是Recovery(收率),磁珠提取過程應當盡量将所有(yǒu)的核酸都能(néng)從樣本中(zhōng)提取出來。高收率對于核酸檢測尤其是疾病早期檢測的靈敏度至關重要,在疾病早期,樣本中(zhōng)的病原體(tǐ)核酸含量通常較低,如果不能(néng)提取到所有(yǒu)核酸,那麽很(hěn)容易出現假陰性,導緻漏檢。

随着基因檢測、個性化給藥、産(chǎn)前診斷等的普及,在生物(wù)行業各領域都追求高通量、自動化,傳統DNA提取方法的局限愈來愈明顯,而磁珠法DNA提取的優勢則愈來愈明顯:能(néng)夠實現自動化、大批量操作(zuò);操作(zuò)簡單、用(yòng)時短;不使用(yòng)傳統方法中(zhōng)的苯、氯仿等有(yǒu)毒試劑,完全符合現代環保理(lǐ)念;與核酸的特異性結合使得提取的核酸純度高、濃度大。

上海領駿生物(wù)科(kē)技(jì )有(yǒu)限公(gōng)司成立于2016年,位于上海市青浦區(qū)張江雲立方園區(qū)。公(gōng)司長(cháng)期緻力于生物(wù)領域内相關産(chǎn)品的研發、生産(chǎn)和銷售,産(chǎn)品主要包括磁性納米材料和磁珠法核酸提取純化試劑。公(gōng)司一直堅持以“質(zhì)量、誠信、團結、奮進”為(wèi)宗旨,嚴格規範質(zhì)量管理(lǐ)體(tǐ)系,持續創新(xīn)、精(jīng)益求精(jīng),為(wèi)客戶提供優質(zhì)的産(chǎn)品和服務(wù),被認定為(wèi)上海市專精(jīng)特新(xīn)企業。

 

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